MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_2

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022649	TC	3	6	942	947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022649	GTTT	2	8	1020	1027	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022649	TACAC	2	10	1038	1047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_022649	C	6	6	1113	1118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_022649	A	9	9	1359	1367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022649	A	6	6	1445	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022649	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_022649	A	6	6	1518	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022649	ACA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022649	GTT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022649	AAC	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022649	ATA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022649	AGAC	2	8	1689	1696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022649	A	6	6	1827	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022649	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022649	CAA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022649	CAT	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022649	A	7	7	1927	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022649	AAC	2	6	1962	1967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022649	CA	3	6	2000	2005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022649	T	7	7	2056	2062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022649	CACAC	2	10	2079	2088	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_022649	A	9	9	2098	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022649	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022649	A	8	8	2294	2301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022649	ATA	2	6	2341	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022649	TA	3	6	2360	2365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022649	AGAACA	2	12	2371	2382	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022649	TAA	2	6	2396	2401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022649	ATTTT	2	10	2404	2413	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022649	T	6	6	2410	2415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022649	TTCCA	2	10	2439	2448	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_022649	AGTA	2	8	2482	2489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022649	TTA	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022649	ACAA	2	8	2530	2537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022649	T	6	6	2590	2595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022649	ATAA	2	8	2611	2618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022649	ATA	2	6	2648	2653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022649	ATC	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022649	AAGCG	2	10	2931	2940	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022649	CGA	2	6	4439	4444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022649	GA	3	6	4447	4452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022649	CTTC	2	8	4467	4474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022649	CCG	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022649	AC	3	6	4546	4551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022649	A	7	7	4555	4561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022649	TCGC	2	8	5025	5032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022649	GCG	2	6	5052	5057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022649	ACC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_022649	A	6	6	5121	5126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022649	CTG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.